Prise en compte de données de dynamique moléculaire pour le choix d’un peptide antimicrobien
Motion as a language: transformer-based classification of antimicrobial peptide conformational dynamicsJournal of Chemical Theory and Computation, 2026, 22, 3, 1215–1223
Les peptides antimicrobiens présentent un potentiel important dans le cadre des antibio-résistances.
Les travaux de Benjamin Bouvier, chercheur au CNRS, dans la revue Journal of Chemical Theory and Computation, se proposent d’explorer un paramètre rarement pris en compte dans les bases de données de petides anti-microbiens: l’espace conformationnel de ces peptides.
L’utilisation de réseaux de neurones similaires à ceux utilisés pour ChatGPT doit permettre d’ajouter cette dimension lors de l’exploration de bases de données pour prendre en compte la plasticité des peptides en lien avec la cible choisie et ainsi cibler des peptides encore plus efficaces.
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